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研究团队利用CT网络促进公众获取开放科学

来源:生活2024-05-23 15:10:21
导读 阅读最新的科学发现(例如,发现代表一种新种小型恐龙的化石)可能会令人着迷。但如果除了阅读之外,还能做更多的事情呢?如果你可以上网,下...

阅读最新的科学发现(例如,发现代表一种新种小型恐龙的化石)可能会令人着迷。但如果除了阅读之外,还能做更多的事情呢?如果你可以上网,下载数字模型,并在阅读新闻几分钟内3D打印出该化石的精确复制品,那会怎样?

这是非临床断层扫描用户研究网络(NoCTURN)的目标,这是一个由亚利桑那大学健康科学学院、美国自然历史博物馆、佛罗里达大学和德克萨斯大学牵头的国际研究小组。他们希望打开科学之门,让每个人都能参与进来。

Gignac及其同事在最近的一篇论文中详细介绍了NoCTURN的开发,论文题目为《网络在克服断层扫描大规模挑战中的作用发表在《材料与结构断层摄影》:非临床断层摄影用户研究网络”中

“各种研究资料库中都有大量的数据集,但全球各地受联邦政府资助进行计算机断层扫描研究的人员的硬盘和服务器上却存储着数十万个数据集,因此只有一小部分数据集可供公众使用,”NoCTURN领导团队成员、亚利桑那大学图森医学院细胞与分子医学副教授PaulGignac博士说道。

“随着数据越来越普遍,研究人员和成像机构希望在公共存储库中共享这些数据,我们希望这种可用性能够扩大十倍。”

计算机断层扫描,通常称为CT扫描计算机断层扫描(在医学领域)通过对复杂、不透明物体进行无损3D成像,已经改变了许多学科的科学。无论是研究有机生物学、制造技术、实验医疗设备、工程结构、地质样本、史前文物还是生物化石,CT都是科学、技术、工程和数学研究和推广工具包的核心要素。

计算机断层扫描作为一种科学工具相对较新——第一台CT扫描仪仅有50多年的历史——并且它的快速普及导致了CT领域的分裂。

“目前有数十家高分辨率CT扫描仪制造商,但它们之间的标准却很少,”Gignac说道。“当我向我的一位同事解释我如何进行扫描时,我们甚至可能使用不同的语言,因为相同参数的术语并不相同。我可以向我的同事发送一些文件,但他或她可能无法使用他们的软件打开它们,因为某些文件类型是专有的。通过NoCTURN,我们正在尝试解决此类互操作性问题。”

NoCTURN是一个国家科学基金会研究协调网络,由来自世界各地42个机构的75名研究人员组成,其共同目标是是改善跨科学学科的数据处理。该组织成立于2022年,当时美国科学技术政策办公室发布了《尼尔森备忘录》,该备忘录更新了政策指导,以促进研究的公平性和透明度,并改善公众获取联邦资助研究成果的机会。

NoCTURN成员与成像设施、学术部门合作和数据存储库合作,鼓励数据共享,同时提高数字资产的可查找性、可访问性、互操作性和重用性。此外,他们还与私营公司合作,标准化数据采集、处理和共享,以更好地反映开放科学的原则。

“开放科学和FAIR原则(可查找、可访问、可互操作和可重复使用)应该成为21世纪科学的基石,”Gignac说道。“我们的目标是制定切实可行的建议,将今天的断层扫描数据与明天的断层扫描发现联系起来。NoCTURN可以成为其他组织如何利用大型网络的力量来激励社区制定开放科学政策和实践的模板。”

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