《孤岛惊魂3》的结局是游戏中的一个高潮，它不仅为整个游戏的故事画上了一个句号，也给玩家留下了深刻的印象。在游戏的最后阶段，主角Jason Brody需要做出一个重要的选择，这个选择不仅关乎个人的命运，还涉及到整个岛屿居民的未来。

在游戏的最终任务中，Jason面临了两个主要的选择：摧毁Rook岛上的广播塔，阻止Vaas的兄弟Dutch Van Gueren控制岛屿；或者帮助Dutch实现他的目标，成为新秩序下的统治者。这两个选择代表了两种截然不同的道德立场和游戏走向。

如果选择摧毁广播塔并击败Dutch，Jason将经历一场与Dutch及其手下激烈战斗的场景，最终成功摧毁广播塔，并且有机会救出被囚禁的人质。这个结局强调了自由和个人主义的价值，同时也展示了Jason作为一个英雄的角色，他为了更大的利益而做出了艰难的决定。

相反，如果选择加入Dutch一方，那么Jason将会成为新秩序的一部分，尽管这可能意味着要牺牲自己的原则。这个选择虽然可能会带来权力和地位，但也会让玩家质疑自己的行为是否正确。

无论玩家选择了哪个结局，《孤岛惊魂3》的结尾都展现了游戏对自由、道德以及人性复杂性的深刻探讨。游戏通过这两个不同的结局，鼓励玩家思考自己的行为所带来的后果，以及如何在混乱的世界中寻找属于自己的道路。这样的设计使得《孤岛惊魂3》不仅仅是一款射击游戏，更是一次关于选择和后果的哲学探索。